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填充型纳流液相色谱长柱的蛋白质组学分析性能考察
王晓飞 , 秦飞 , 郭睿 , 张博
doi:  10.19756/j.issn.0253-3820.181737
纳流液相色谱长柱用于蛋白质组学分析中,可以显著提高多肽的分离度和检出率,进而提高蛋白质的鉴定数目和可信度。本研究基于纳流液相色谱-电喷雾质谱联用平台,考察了柱床长度为1.5 m的超长纳流液相色谱柱,将其用于蛋白质组学分析中。与常规纳流色谱柱相比,使用长柱时,复杂多肽样品得到了优良的分离效果。蛋白质组学数据检索结果表明,使用1.5 m长柱进行前端的色谱分离,采用质谱识别肽段数提升了83.6%,肽段数目提升了74.4%,唯一肽段数目提升了75.0%,蛋白质鉴定数目提升了38.4%。研究结果表明,这类填充型纳流液相色谱长柱为高分辨蛋白质组学提供了一种新的分离工具。
关键词: 纳流液相色谱, 毛细管液相色谱, 填充柱, 蛋白质组学, 质谱
长期砷暴露的大鼠尿液代谢组学研究
王晓飞 , 沈运旺 , 朱珏 , 张博
doi:  10.19756/j.issn.0253-3820.181762
慢性无机砷暴露可引发多种疾病和损害,但其所涉及的生物学过程尚未完全阐明。全球约有超过2亿人面临饮用水砷污染的威胁。本研究以自由饮水的方式对健康大鼠进行无机砷的长期暴露,并对大鼠尿液的代谢组变化进行系统分析。结果表明,长期砷暴露大鼠的尿液代谢组与对照组具有显著区别,且高剂量砷暴露对大鼠尿液代谢组产生的影响更显著。本研究共鉴定出36种差异代谢物,其中14种与氨基酸代谢相关的代谢物发生了显著变化,涉及到色氨酸代谢、精氨酸和脯氨酸代谢、赖氨酸降解、β-丙氨酸代谢、半胱氨酸和蛋氨酸代谢、甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢; 11种与脂类代谢相关的代谢物,涉及到的代谢通路有鞘脂代谢、脂肪酸代谢;同时发现蛋白质的表达与翻译后修饰也受到干扰。这些生物学过程的改变均可作为砷毒性机理的关键分子事件。
关键词: 砷暴露, 代谢组学, 尿液, 长期暴露, 液相色谱-质谱
胶束电动色谱技术在蛋白质分离分析中的应用研究进展
高凡 , 王晓飞 , 张博
doi:  10.19756/j.issn.0253-3820.181742
胶束电动色谱(MEKC)作为一种兼具色谱和电泳分离机理的方法,既具有准固定相与分析物间的相互作用,又可以利用带电分子在电场中迁移行为的差异进行分离。MEKC的这些特点在蛋白质和多肽这类具有高维度数的生物分子的分离中得到了很好的体现。无论是单维分离,还是多维分离,MEKC都显现出在生物大分子分离方面良好的应用前景。近年来,随着CE-MS的不断发展,出现了很多新的MEKC-MS联用技术,进一步显示了MEKC在蛋白质与多肽分离分析中的应用前景。本文首先对胶束电动色谱技术进行了简介,综述了近年来胶束电动色谱技术在蛋白质分离分析中的研究应用进展,并对其发展前景进行了展望。
关键词: 胶束电动色谱, 表面活性剂, 毛细管电泳, 蛋白质, 多肽, 质谱, 评述